Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
STRIP1Q5VSL9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
STRIP1Q5VSL9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms