Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GEN1Q17RS7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms