Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
NTRK3Q16288 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
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