Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHBQ15464 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHBQ15464 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHBQ15464 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHBQ15464 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHBQ15464 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHBQ15464 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHBQ15464 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHBQ15464 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHBQ15464 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHBQ15464 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHBQ15464 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SHBQ15464 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SHBQ15464 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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