Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDE6HQ13956 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms