Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXOSC9Q06265 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms