Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms