Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CENPEQ02224 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CENPEQ02224 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms