Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NME5P56597 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NME5P56597 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NME5P56597 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NME5P56597 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms