Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP5P45974 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP5P45974 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP5P45974 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP5P45974 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP5P45974 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP5P45974 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP5P45974 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP5P45974 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP5P45974 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP5P45974 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP5P45974 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP5P45974 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP5P45974 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP5P45974 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP5P45974 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP5P45974 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP5P45974 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP5P45974 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP5P45974 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP5P45974 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP5P45974 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP5P45974 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP5P45974 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP5P45974 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP5P45974 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP5P45974 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP5P45974 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP5P45974 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP5P45974 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP5P45974 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP5P45974 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP5P45974 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP5P45974 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP5P45974 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP5P45974 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP5P45974 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP5P45974 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP5P45974 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP5P45974 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP5P45974 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP5P45974 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP5P45974 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP5P45974 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP5P45974 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP5P45974 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP5P45974 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP5P45974 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP5P45974 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms