Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CHRNA4P43681 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms