Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPS1P31327 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPS1P31327 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPS1P31327 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPS1P31327 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPS1P31327 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPS1P31327 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPS1P31327 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPS1P31327 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPS1P31327 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPS1P31327 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPS1P31327 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPS1P31327 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPS1P31327 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPS1P31327 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPS1P31327 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPS1P31327 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CPS1P31327 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPS1P31327 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPS1P31327 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPS1P31327 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPS1P31327 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPS1P31327 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPS1P31327 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPS1P31327 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPS1P31327 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPS1P31327 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPS1P31327 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPS1P31327 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPS1P31327 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPS1P31327 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPS1P31327 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPS1P31327 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPS1P31327 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPS1P31327 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPS1P31327 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPS1P31327 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPS1P31327 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CPS1P31327 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CPS1P31327 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPS1P31327 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPS1P31327 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPS1P31327 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPS1P31327 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPS1P31327 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPS1P31327 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPS1P31327 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPS1P31327 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPS1P31327 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms