Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCAP28676 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCAP28676 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCAP28676 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GCAP28676 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GCAP28676 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GCAP28676 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GCAP28676 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GCAP28676 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms