Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PSMA1P25786 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PSMA1P25786 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms