Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms