Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MS4A1P11836 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms