Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD8BP10966 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD8BP10966 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CD8BP10966 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD8BP10966 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CD8BP10966 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD8BP10966 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD8BP10966 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD8BP10966 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD8BP10966 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD8BP10966 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD8BP10966 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD8BP10966 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD8BP10966 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD8BP10966 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD8BP10966 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CD8BP10966 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD8BP10966 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD8BP10966 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD8BP10966 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD8BP10966 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD8BP10966 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD8BP10966 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD8BP10966 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD8BP10966 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CD8BP10966 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD8BP10966 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD8BP10966 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD8BP10966 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD8BP10966 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD8BP10966 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD8BP10966 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD8BP10966 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD8BP10966 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD8BP10966 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD8BP10966 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD8BP10966 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms