Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGAP02671 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FGAP02671 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FGAP02671 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FGAP02671 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FGAP02671 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGAP02671 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGAP02671 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGAP02671 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGAP02671 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGAP02671 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGAP02671 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGAP02671 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGAP02671 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGAP02671 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGAP02671 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FGAP02671 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms