Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ERVV-2B6SEH9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms