Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SYCE3A1L190 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYCE3A1L190 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms