Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TMED7Q9Y3B3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms