Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNX12Q9UMY4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms