Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MRTO4Q9UKD2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms