Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
NDUFA12Q9UI09 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NDUFA12Q9UI09 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms