Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PODXL2Q9NZ53 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PODXL2Q9NZ53 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms