Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MS4A12Q9NXJ0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms