Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMC4Q9NTJ3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms