Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC4BQ9NT99 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC4BQ9NT99 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms