Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNRC6CQ9HCJ0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6CQ9HCJ0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6CQ9HCJ0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6CQ9HCJ0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6CQ9HCJ0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6CQ9HCJ0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6CQ9HCJ0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6CQ9HCJ0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6CQ9HCJ0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6CQ9HCJ0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6CQ9HCJ0 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6CQ9HCJ0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6CQ9HCJ0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6CQ9HCJ0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6CQ9HCJ0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6CQ9HCJ0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6CQ9HCJ0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6CQ9HCJ0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNRC6CQ9HCJ0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms