Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC044839.1-208ENST00000634902 917 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SENP3Q9H4L4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 AP005202.1-202ENST00000583065 748 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 IMPG1-203ENST00000369963 868 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 LINC00426-204ENST00000420219 1056 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 Z97198.1-201ENST00000452366 658 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 AC104116.1-201ENST00000504539 411 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 AC007922.2-201ENST00000579049 281 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 AC096751.2-201ENST00000507483 792 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SENP3Q9H4L4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms