Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCGF6Q9BYE7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCGF6Q9BYE7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms