Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF4Q9BUZ4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms