Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX21Q969T3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX21Q969T3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX21Q969T3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX21Q969T3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX21Q969T3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX21Q969T3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX21Q969T3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX21Q969T3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX21Q969T3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX21Q969T3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX21Q969T3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX21Q969T3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX21Q969T3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX21Q969T3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX21Q969T3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX21Q969T3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX21Q969T3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX21Q969T3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX21Q969T3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX21Q969T3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX21Q969T3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX21Q969T3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SNX21Q969T3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX21Q969T3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX21Q969T3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX21Q969T3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX21Q969T3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX21Q969T3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX21Q969T3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX21Q969T3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX21Q969T3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX21Q969T3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX21Q969T3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX21Q969T3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX21Q969T3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX21Q969T3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX21Q969T3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX21Q969T3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX21Q969T3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX21Q969T3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX21Q969T3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX21Q969T3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX21Q969T3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SNX21Q969T3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SNX21Q969T3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX21Q969T3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX21Q969T3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SNX21Q969T3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms