Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NKD1Q969G9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NKD1Q969G9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms