Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-CQ95604 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms