Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RABGGTAQ92696 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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RABGGTAQ92696 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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RABGGTAQ92696 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
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RABGGTAQ92696 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
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RABGGTAQ92696 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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RABGGTAQ92696 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RABGGTAQ92696 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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