Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GNPDA2Q8TDQ7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms