Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCDC63Q8NA47 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms