Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CLIP4Q8N3C7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CLIP4Q8N3C7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CLIP4Q8N3C7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLIP4Q8N3C7 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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