Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
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