Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBR3Q6ZT12 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBR3Q6ZT12 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
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