Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CAPN12Q6ZSI9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms