Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q6P435 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q6P435 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q6P435 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q6P435 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q6P435 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Q6P435 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q6P435 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q6P435 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q6P435 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q6P435 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6P435 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6P435 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6P435 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6P435 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6P435 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6P435 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6P435 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6P435 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6P435 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6P435 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6P435 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6P435 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6P435 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6P435 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6P435 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6P435 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6P435 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6P435 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6P435 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q6P435 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6P435 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q6P435 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q6P435 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms