Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF123Q5XPI4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF123Q5XPI4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms