Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NHSL1Q5SYE7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NHSL1Q5SYE7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms