Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC153Q494R4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms