Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC18A3Q16572 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC18A3Q16572 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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