Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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