Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRADDQ15628 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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