Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBX1Q14549 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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GBX1Q14549 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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